Deși dispune de zăcăminte limitate de lignit, fosforit și gips, Moldova este considerată relativ săracă în resurse naturale, din cauza lipsei de rezerve importante de cărbune, gaz sau petrol.
În ceea ce privește potențialul surselor de energie regenerabilă (SRE), în special cel eolian și solar, acesta nu este exploatat în totalitate. Cu toate acestea, datorită activității agricole intense din țară, biomasa solidă este considerată una dintre cele mai importante surse de energie regenerabilă, având potențialul de a fi utilizată pe scară largă pentru producerea de energie.
Cele două râuri principale din Moldova sunt Nistrul și Prutul, ambele izvorând din Munții Carpați din Ucraina.